使用Neurosynth进行大脑元分析
- 由于人类脑影像数据的迅速发展,研究者们越来越难以汇聚(aggregate)和综合(synthesis)脑影像的发现。Tal Yarkoni等人开发了一种方法,利用元分析和计算机学习等方法得到了神经-认知状态之间大量的数据图片。这种方法可解决脑影像分析中的推论问题,以及从脑影像数据解码(deconding)认知活动的问题。
- Neurosynth就是Tal Yarkoni等人方法转化的成果,是一个可以在线即时对脑影像数据产生元分析图谱的工具。Neurosynth允许用户通过输入任何与脑影像相关的关键词来产生元分析图谱。
How to use
Maps菜单
- Neurosynth的使用直观易学。只需要在搜索框中输入关键词(例如“pain”或者“cognitive control”),就能即时地产生与关键词相关的统计图谱。
- 激活图谱可以利用可选项进行深入分析,可选项主要包括:
- forward inference
- reverse inference
- the consistency of that activation across studies
- the probability that you would observe the reporting of a term given a particular location
- anotimical(底板)
- 激活图谱的呈现方式类似于PS,采用图层(Layers)的方式。
- 点击绿色的What’here? ,可以得到以这个点为中心的静息态功能连接或元分析共同激活图谱(Functional connectivity and coactivation maps)。例如选取PCC为点,点击What’here?,就可以得到默认网络的激活图。
- 最终的图谱可以导出为NIFTI格式的文件,然后用于多种用途。例如综述插图,或者制作感兴趣区域的masks。
Studies and Associations菜单
- Studies。Neurosynth also serves as an excellent education tool for learning what specific regions are associated with which cognitive processes and which author’s work.
- Associations。人们可以查看以当前体素为种子点与全脑其他体素的功能连接表。
References
Yarkoni, T., et al. (2011). “Large-scale automated synthesis of human functional neuroimaging data.” Nature Methods 8(8): 665.
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